مرتضی فنونی‌زاده در گفت‌وگو با ایرنا در رابطه با ابقای اسکوچیچ، اظهار داشت: خودم جزو معدود کسانی بودم که از اسکوچیچ حمایت می‌کردم. واقعا هم در آن زمان خیلی از مربی‌های داخلی و خارجی این ریسک را نمی‌کردند که هدایت تیم ملی را برعهده بگیرند ولی این مربی این کار را انجام داد و موفق شد تیم ملی را راهی جام‌جهانی کند.
وی افزود: با شرایطی که پیش آمد و مخصوصا اتفاقات اردوی قطر و بازی تدارکاتی مقابل الجزایر به‌نظرم این مربی فقط به دنبال جمع کردن رزومه است که بتواند بعد از جام‌جهانی در تیم‌های اروپایی مربیگری کند و خلاف گفته‌های دیگران اصلا مربی ارزانی نیست و بهتر است با اسکوچیچ خداحافظی کنیم.
پیشکسوت فوتبال کشورمان در رابطه با اختلاف بازیکنان با سرمربی تیم ملی گفت: اصلا نباید بازیکنان مقابل سرمربی تیم ملی جبهه بگیرند. خودم این اشتباه را در سال ۱۳۶۵ در بازی‌های آسیایی انجام دادم و طولی نکشید که از این کار پشیمان شدم. در آن زمان ۱۴ نفر از بازیکنان تیم ملی که ۱۰ نفر از آنها بازیکنان مطرح تیم بودند علیه مرحوم دهداری که هدایت تیم ملی را بر عهده داشت حرف‌هایی زدند و فکر می‌کردیم که می‌توانیم سرمربی تیم را برکنار کنیم ولی برعکس این اتفاق صورت گرفت و همه ۱۴ نفر از تیم ملی کنار گذاشته شدند. همان موقع هم خلاف میل باطنی این کار را انجام دادم و بلافاصله هم از مرحوم دهداری عذرخواهی کردم و او هم بزرگواری کرد من و فرشاد پیوس را به تیم ملی برگرداند.
وی افزود: در حال حاضر هم باید با این بازیکنان برخورد شود. از حمید استیلی هم گله‌مند هستم و او باید به عنوان سرپرست مانع چنین رفتاری می‌شد. همه بازیکنان سرباز تیم ملی هستند و باید این را بدانند که در این چند سالی که بازی می‌کنند حق ندارند برای سرمربی و کادر فنی تعیین و تکلیف کنند.
فنونی‌زاده در مورد شایعه بازگشت کارلوس کی‌روش به تیم ملی ایران اظهار داشت: بازگشت او به صلاح فوتبال ما نیست. هشت سال اینجا پول گرفت و به ریش ما خندید. بدون اینکه یک جام بیاورد. دو بار هم به عراق باخت.
وی افزود: حضور در جام جهانی برای ما مثل آب خوردن شده و مردم هم عادت کرده‌اند. مهم صعود به دور بعد است. البته امسال مقداری دور از دسترس است اما اگر مدیران فدراسیون می‌خواهند مربی را عوض کنند که باید هم عوض کنند، یک مربی خارجی خوب بیاورند. اسکوچیچ زحمت خودش را کشید اما در حد و اندازه‌های جام‌جهانی نیست. مربیان خارجی زیاد و خوبی هستند که می‌توانیم از آنها استفاده کنیم.
مدافع اسبق تیم ملی گفت: تنها حسنی که کی‌روش داشت این بود که به کسی باج نمی‌داد اما تا دلتان بخواهد عیب داشت. نتایج و سیستم او را هم دیدیم. کلمبیا را ضعیف کرده بود و می‌گفت بیایید دفاع کنیم. این کار شاید در ایران جواب می‌داد اما کلمبیا چند بار برزیل و آرژانتین را برده بود. یا در مصر، محمد صلاح دفاع چپ شده بود اما ببینید یورگن کلوپ چقدر قشنگ از او استفاده می‌کند. با این حال سیستم او به درد ایران هم نمی‌خورد. تیم ملی باید مثل استقلال و پرسپولیس هجومی بازی کند.
فنونی‌زاده با اشاره به گذشته تیم ملی عنوان کرد: زمان ما اگر هم می‌باختیم بازی‌ها پرگل بود که با اختلاف یک گل می‌باختیم. یعنی ۴-۳ یا ۳-۲، باختمان هم جذاب بود و بازی لذت‌بخش می‌شد. اسکوچیچ را عوض کنند اما نباید کی‌روش را بیاورند. مربی خارجی زیاد است. کی‌روش ۸ سال دلار گرفت. چقدر هزینه داشت؟ چند دستیار داشت. یکی دو ایرانی هم کنارش بودند که همه را کنار گذاشت و فقط مارکار را نگه داشت. هیچ دستاوردی برای ما نداشت. دو حضور در جام جهانی داشت که من هم بودم این اتفاق می‌افتاد. مهم این است که به عراق و ژاپن نبازیم. اگر در جام جهانی هم خوب بازی کردیم به خاطر این بود که نفرات خوبی داشتیم.
وی افزود: ما گزینه‌های داخلی خوبی مثل امیر قلعه نویی، علی دایی و حسین فرکی را داریم که می‌توانند در این مقطع به تیم ملی کمک کنند و در گزینه‌های خارجی نیز فقط برانکو می‌تواند خوب باشد و به نظر من ترکیب برانکو و فرکی نیز بسیار عالی خواهد بود.
پیشکسوت فوتبال کشورمان در رابطه با نامزد شدن مهدی تاج برای ریاست فدراسیون فوتبال اظهار داشت: با توجه به باز بودن پرونده ویلموتس باید بلافاصله سازمان بازرسی کل کشور ورود کند تا مشخص شود که چه کسانی خطاکار بوده‌اند. فکر می‌کنم خیلی‌ها با توجه به اینکه قرار است چند میلیون دلار به حساب فدراسیون ایران واریز شود، بوی کباب به مشام‌شان خورده است و کاندید ریاست فدراسیون شدند. ان‌شاءالله اتفاقات خوبی در جام جهانی بیافتد. تنها دلخوشی مردم این فوتبال است. امیدوارم مجمع فدراسیون تصمیم درستی بگیرد و در شهریورماه، گزینه درستی برای ریاست فدراسیون انتخاب شود.